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 細菌細胞在固體培養基表面形成的細胞菌體叫菌落（colony）。不同微生物在某種培養基上生長繁殖，所形成的菌落特征有很大差異，而同一種的細菌在一定條件下，培養特征卻有一定穩定性。以此可以對不同微生物加以區別鑒定。因此，微生物培養特性的觀察也是微生物檢驗鑒別中的一項重要內容。

細菌菌落的特征描述應當包括：菌落的大小、形態、顏色、光澤度、透明度、質地、隆起狀態、邊緣特征等。常用的描述詞匯如下：
大小：菌落覆蓋的范圍，一般描述菌落的直徑即可。
形態：指菌落的外觀形狀，常用詞匯包括圓形、卵圓形、三角形、形狀不規則等。
顏色：包括正反面顏色，即氣生菌絲和基內菌絲顏色，常用詞匯包括：白色、乳白色、紅色、粉色、黑色、無色等。
光澤度：指表面有無光澤，可直接描述為菌落表面有光澤、無光澤、表面光滑、粗糙等。一般有莢膜的菌落表面有光澤，無莢膜的菌落表面無光澤。
透明度：描述菌落透光的性質，常用詞匯包括：透明、半透明、不透明。
質地：指菌落的粘性、脆性等，常用詞匯包括：蠟狀、干燥、易挑起、粘稠感等。
隆起狀態：指菌落切面的形態，常用詞匯包括：隆起、凸起、扁平等。
邊緣特征：指菌落周邊的形狀，常用詞匯包括：波狀、完整、粉粒狀、嚙齒狀等。

一般對菌落的描述可以從以上幾個方面進行，但不必包括以上所有項目，只需要根據菌落的關鍵特征，挑取最關鍵的幾項進行描述即可，一般情況下挑選4-6項就可以把菌落描述清楚，但有些特殊菌落可能還需要根據具體情況加入一些其他的描述語言。常見的細菌在一些特定培養基上的形成的菌落描述見下表：